El estudio, catalogación, conservación y difusión del patrimonio histórico-médico e histórico-científico es uno de los objetivos del instituto. Dos son las colecciones que forman parte de nuestros fondos: la colección histórico-médica y colección de instrumentos científicos.

Ambos fondos constituirán el Museo de Historia de la Medicina y de la Ciencia (actualmente en fase de organización), como parte integrante del instituto. La colección histórico-médica corresponde al Museo Histórico-Médico de la Facultad de Medicina, creado y dirigido por el profesor José María López Piñero y gestionado con la ayuda del profesor Juan Micó Navarro, que conserva instrumentos, aparatos y otras piezas médicas procedentes del Hospital Clínico de Valencia y de la propia Facultad de Medicina de la Universitat de València, así como de generosas donaciones de algunas familias, como Carreras, Bonilla, Navarro, Simón, Bartrina, Carmena, Barberá, Alcover, Puche o Catalá. El museo ofrecerá un recorrido cronológico por la historia de la medicina en España y Valencia, especialmente en la edad contemporánea, dentro del contexto internacional.

La colección científica que formará parte del Museo de Historia de la Medicina y de la Ciencia procede de materiales pertenecientes a la Facultad de Física, la Facultad de Química, la Escuela Universitaria de Magisterio y el Observatorio Astronómico de la Universidad de Valencia, entre los que se encuentran instrumentos de análisis químico, óptica, electrónica, mecánica, termodinámica, etc., que constituyen valiosas fuentes materiales para la investigación, la enseñanza de la historia de la ciencia y la divulgación científica.

Colección histórico-médica
Exposición digital de la colección histórico-médica permanente conservada en el Museo de Historia de la Medicina y de la Ciencia (en fase de organización). La versión digital está destinada principalmente a estudiantes universitarios.

Colección histórico-científica
Catálogo de instrumentos científicos de la Universitat de Valéncia.